Il est possible d'importer dans Mendeley des références provenant d'un autre logiciel de gestion bibliographique, tels EndNote ou Zotero. Il faut d'abord exporter ses références dans un format standard (par ex. RIS).
Notez que les types de documents et les champs bibliographiques utilisés varient d'un logiciel à un autre, certaines informations ne se transfèreront pas correctement. Il est important de valider les données après l'importation.
Si vous avez déjà une bibliothèque Mendeley, il est recommandé de commencer par créer une
copie locale de votre bibliothèque. De cette façon, si l'importation s'avère problématique, vous pourrez récupérer votre bibliothèque Mendeley originale.